La Biobanque
québécoise de
la COVID-19

Ressources scientifiques
pour l’étude de la COVID-19

Notre mission : 

faciliter la recherche

La BQC19 permet de fédérer les efforts de recherche de plusieurs établissements de recherche du Québec et facilite les collaborations de recherche à l’échelle nationale et internationale.

La mission de la BQC19 est de veiller à ce que les scientifiques aient accès à du matériel biologique de qualité provenant de patients situés partout au Québec, à leurs données cliniques ainsi qu’à des analyses multiomiques réalisées sur sa propre collection. La BQC19 adhère aux principes de la science ouverte et reconnaît que le partage de ces ressources contribue aux efforts de recherche sur la COVID-19 afin de répondre efficacement aux défis de santé publique que représentent la pandémie sur des bases scientifiques solides et dans un cadre éthique et juridique approprié.

Ressources
pour les chercheurs

Matériel disponible

La BQC19 met à disposition de la communauté scientifique des échantillons biologiques provenant des suivis longitudinaux sur une période de 24 mois de patients ayant développé la COVID-19 et de participants témoins.

Découvrez le matériel disponible

Données disponibles

En plus des données cliniques variées et de qualité, la BQC19 partage aussi les résultats de nombreuses analyses multiomiques réalisées sur ses propres échantillons.

Découvrez les données disponibles

Demande d’accès à la BCQ19

Accédez à du matériel biologique et à des données de haute qualité provenant de patients infectés et non infectés par SRAS-CoV-2. Les échantillons collectés étant une ressource précieuse, limitée et non renouvelable, les demandes d’accès seront étudiées de façon rigoureuse par le comité d’accès de la BQC19.

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Publications

Découvrez et consultez nos publications scientifiques.

Pathak GA, Karjalainen J, Stevens C, Neale BM, Daly M, Ganna A, et al.
Nature. 2022 Aug;608(7921):E1‑10.

A first update on mapping the human genetic architecture of COVID-19.

Cette étude présente une méta-analyse d’études de GWAS réunissant 125 584 cas de COVID-19 et plus de 2,5 millions de témoins provenant de 60 études réparties sur 25 pays. Onze nouveaux loci génomiques significatifs ont été identifiés par rapport aux précédents, notamment des gènes liés à la susceptibilité et à la sévérité de la maladie, tels que SFTPD, MUC5B et ACE2. Les analyses ont examiné trois phénotypes : les individus gravement malades nécessitant un soutien respiratoire, les cas modérés ou graves hospitalisés et l’ensemble des cas rapportés d’infection par le SARS-CoV-2, quel que soit le symptôme. Un total de 23 loci ont montré une association significative avec le COVID-19 (P < 5 × 10−8), dont 20 ont conservé leur signification après correction pour les tests multiples (P < 1,67 × 10−8). Comparativement à l'analyse précédente, un seul locus (rs72711165) n’a pas été répliqué, tandis que tous les autres ont montré une augmentation significative de la validité statistique. Ces découvertes apportent des éclairages essentiels sur les mécanismes biologiques de la susceptibilité et de la sévérité du COVID-19.

Kousathanas A, Pairo-Castineira E, Rawlik K, Stuckey A, Odhams CA, Walker S, et al.
Nature. 2022 Jul;607(7917):97‑103.

Whole-genome sequencing reveals host factors underlying critical COVID-19.

Cette étude analyse les variations génétiques liées à la COVID-19 grave en utilisant le séquençage génomique de 7 491 individus gravement malades et de 48 400 témoins. L’étude identifie 23 variantes indépendantes prédisposant à une forme sévère de la maladie, dont 16 nouvelles, impliquant des gènes associés à la signalisation de l’interféron, la différenciation des leucocytes et le statut de sécréteur des antigènes du groupe sanguin. Des analyses d’expression génique et de randomisation mendélienne mettent en évidence des cibles thérapeutiques potentielles, notamment des molécules d’adhésion des cellules myéloïdes et le facteur de coagulation F8. Ces résultats suggèrent un modèle multifactoriel dans la pathophysiologie de la COVID-19 grave, avec des mécanismes liés à la réplication virale et à l’inflammation pulmonaire.

Huffman JE, Butler-Laporte G, Khan A, Pairo-Castineira E, Drivas TG, Peloso GM, et al.
Nat Genet. 2022 Feb;54(2):125‑7.

Multi-ancestry fine mapping implicates OAS1 splicing in risk of severe COVID-19.

Le groupe OAS1/2/3 a été identifié comme un locus de risque pour la forme grave de la COVID-19 chez les individus d’ascendance européenne, avec un haplotype protecteur d’environ 75 kilobases (kb) dérivé des Néandertaliens dans la région chromosomique 12q24.13. Cet haplotype contient une variante d’épissage du gène OAS1, présente chez les personnes d’ascendance africaine indépendamment de l’hérédité néandertalienne. À l’aide d’approches de cartographie fine trans-ancestrales dans un échantillon de 20 779 cas hospitalisés, l’étude montre que cette variante d’épissage est probablement le SNP responsable de l’association à ce locus, ce qui implique fortement le gène OAS1 comme un gène effecteur influençant la gravité de la COVID-19.

Actualités

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Bonification des ensembles de données – ROCHE, GWS et clinique

Montréal, Qc. La Biobanque québécoise de la COVID-19 (BQC19) a le plaisir d’annoncer une nouvelle…

Mille mercis pour votre participation

Chers participants, chères participantes de la BQC19, Nous vous contactons aujourd’hui pour premièrement vous remercier…