Design de l'étude

  1. Accueil
  2. Recherche
  3. Design de l'étude
Design de l'étude

Cadre de gestion

Le cadre de gestion contient les règles et procédures de fonctionnement de la Biobanque québécoise de la COVID-19 (BQC19) et est disponible dans la section « documents disponibles ».

Accès au matériel biologique et aux données

L'accès à du matériel biologique et à des données de haute qualité provenant de patients infectés et non infectés par SARS-CoV-2 est absolument essentiel pour mieux connaître les déterminants de COVID-19. Les échantillons collectés étant une ressource précieuse, limitée et non renouvelable, les demandes d’accès seront étudiées de façon rigoureuse afin de d’optimiser (maximiser) leur utilisation et d’assurer que les analyses proposées sont pleinement justifiées et auront un impact potentiel important sur l’avancement de la recherche sur la COVID-19. Tout le matériel biologique collecté sera traité par l’un des établissements participants à la BQC19 selon les Modes opératoires normalisés de l’établissement pour assurer une conservation optimale. Ces procédures nécessitent également que les données cliniques requises soient liées informatiquement aux prélèvements dans l’application de gestion de données BTRSRV2 et que la gestion et l’inventaire soient maintenus à jour dans BTRSRV2.

Les données et les connaissances scientifiques sont des biens communs et doivent être partagées dans un cadre approprié. La BQC19 souscrit pleinement aux principes énoncés dans la Déclaration de la fondation Wellcome (mars 2020) portant sur le partage des données et découvertes issues de la recherche sur la COVID-19 “Sharing research data and findings relevant to the novel coronavirus (COVID-19) outbreak” disponible sur: https://wellcome.ac.uk/press-release/sharing-research-data-and-findings-relevant-novel-coronavirus-covid-19-outbreak. La COVID-19 représentant une menace importante et urgente pour la santé mondiale, la BQC19 s’engage à veiller à ce que les résultats de la recherche effectuée avec ses ressources et les données relatives à cette épidémie soient partagés rapidement et ouvertement afin d'informer la réponse de santé publique et de contribuer à sauver des vies.

Plus précisément, et en accord avec l’énoncé du Wellcome Trust :

  • Les données seront partagées aussi rapidement et aussi largement que possible avec la communauté scientifique, la santé publique et l’OMS, ainsi que les protocoles et les standards utilisés dans la collecte de données
  • Toutes les publications de recherche revues par les pairs et qui sont pertinentes à la pandémie actuelle seront immédiatement mises à disponibilité en « Open Access » ou accessibles gratuitement au moins pendant la durée de la pandémie.

Les chercheurs qui obtiennent l'accès aux données et aux échantillons de la BQC19 devront fournir une copie de leurs données dérivées à la BQC19, conformément à l'entente de transfert mise en place. La nature exacte des données dérivées et le délai dans lequel elles doivent être fournies seront déterminés au cours du processus d'examen et seront inclus dans l'entente de transfert. Ces données dérivées feront partie intégrante des données de recherche de la BQC19 et seront mises à la disposition d'autres chercheurs qui accèderont à l’avenir à la BQC19, leur permettant ainsi l’accès à ces données enrichies.

Les chercheurs utilisant le matériel biologique et les données de la BQC19 devront mentionner dans leurs communications scientifiques (écrites et orales) que le matériel ou les données utilisés ont été obtenus de la BQC19. Ils devront également mentionner l’apport financier du Fonds de recherche du Québec-Santé (FRQS), de Génome Québec et de l’Agence de la santé publique du Canada. Lorsque leurs communications auront été publiées, ils devront transmettre au gestionnaire de la BQC19 une copie des publications et des documents y faisant référence, par exemple des communiqués de presse. Toute entente de transfert de matériel biologique ou de données inclura les dispositions nécessaires à cet effet.

Matériel disponible

Matériel disponible (présentement)
Chez l'adulte
Extrait ARN (provenant de tube PAXgene)
Extrait ADN (provenant de sang complet sur ACD)
Plasma (provenant de tubes ACD)
PBMC (en quantité extrêmement limitée)
Sérum 
Chez l'enfant
Extrait ARN (provenant de tube PAXgen)
Extrait ADN (provenant de sang complet sur ACD)
Plasma (provenant de tubes ACD)
PBMC (en quantité extrêmement limitée)
Sérum 
Urine (possible)
Selles
Prélèvement nasal (possible)
Matériel disponible (à venir)
Chez la femme enceinte (en quantité très limitée)
Prélèvements vaginaux
Liquide amniotique
Sang de cordon
Lait maternel

Données cliniques

    Hospitalisé   Suivi post-congé hospitalier
  Arrivée J0 J2 J7 J14 J30 Congé 1M 3M 6M 12M 18M 24M
Participant                          
Sexe à la naissance •                        
Pays de naissance •                        
Statut vital • • • • • • • • • • • • •
Date du dernier statut vital connu • • • • • • • • • • • • •
Date du décès • • • • • • • • • • • • •
Heure du décès • • • • • • • • • • • • •
Lieu du décès • • • • • • • • • • • • •
Cause du décès • • • • • • • • • • • • •
Participant pédiatrique                          
Enfant de moins d'un an •                        
Poids à la naissance •                        
Gestation •                        
Volet pédiatrique                          
Patiente enceinte ? •                        
Date d'accouchement prévue •                        
Post partum (accouchement dans la dernière année) •                        
Résultat de la grossesse •                        
Date d'accouchement •                        
Statut COVID du bébé •                        
Bébé testé pour les pathogènes infectieux de la mère •                        
Résultat •                        
Méthode •                        
Type de participant                          
Type de participant •                        
Diagnostic principal (ou primaire) relatif à l'hospitalisation •                        
Est-il un travailleur du milieu de la santé •                        
Est-il un travailleur dans un laboratoire de microbiologie •                        
Vit •                        
Vit avec •                        
Données démographiques                          
Âge au moment de la visite • • • • • • • • • • • • •
Taille •                        
Poids •                        
IMC •                        
Tabagisme et consommation de drogues                          
Statut tabagique •                        
Cigarette électronique •                        
Commentaire sur le tabagisme •                        
Usage de drogues •                        
Type de drogue •                        
Signes vitaux et évaluation quotidienne                          
Température • • • • • •              
Fréquence respiratoire • • • • • •              
Fréquence cardiaque • • • • • •              
Saturation d'O2 à l'air ambiant • • • • • •              
Oxygénothérapie • • • • • •              
Saturation d'O2 en oxygénothérapie • • • • • •              
FiO2 • • • • • •              
Pression systolique / diastolique • • • • • •              
Échelle AVPU   • • • • •              
Score de Glasgow (GCS/15)   • • • • •              
Flot urinaire en 24h   • • • • •              
Symptômes documentés                          
Asymptomatique •             • • • • • •
Date d'apparition de(s) premiers(s) symptômes •             • • • • • •
Fièvre •             • • • • • •
Maux de gorge •             • • • • • •
Toux •             • • • • • •
Dyspnée •             • • • • • •
Hémoptysie/Sang dans l'expectoration •             • • • • • •
Rhinorrhée •             • • • • • •
Pharyngite •             • • • • • •
Mal d'oreilles •             • • • • • •
Arthralgie •             • • • • • •
Fatigue •             • • • • • •
Douleur thoracique •             • • • • • •
Douleur abdominale •             • • • • • •
Myalgie •             • • • • • •
Respiration sifflante •             • • • • • •
Nausée / vomissement •             • • • • • •
Maux de tête •             • • • • • •
Confusion •             • • • • • •
Diarrhée •             • • • • • •
Convulsions •             • • • • • •
Conjonctivite •             • • • • • •
Démangeaisons de la peau •             • • • • • •
Anorexie •             • • • • • •
Oedème des jambes •             • • • • • •
Trouble de la parole (Aphagie/dysphasie) •             • • • • • •
Perte du goût/perte de l'odorat •             • • • • • •
Faiblesse ou engourdissement aux extrémités •             • • • • • •
Antécédents médicaux                          
AVC antérieur •                        
Accident ischémique transitoire (AIT) antérieur •                        
Fibrillation auriculaire ou flutter •                        
Autre problème neurologique (autre que AVC/AIT) •                        
Infarctus du myocarde antérieur •                        
Maladie coronarienne •                        
Insuffisance cardiaque •                        
Fraction d'éjection du ventricule gauche de base pré-hospitalisation •                        
Autre problème cardiaque chronique •                        
Maladies hématologiques chroniques •                        
Diabète •                        
Obésité •                        
Hypertension •                        
Asthme •                        
Problèmes rhumatologiques •                        
Problèmes rénaux chroniques •                        
Dialyse •                        
MPOC: Bronchite chronique, emphysème •                        
Sévérité de la MPOC •                        
Hypertension pulmonaire •                        
Autres problèmes pulmonaires chroniques •                        
Démence •                        
Problèmes psychiatriques •                        
Maladie hépatique chronique •                        
Malnutrition •                        
Cancer •                        
Type de cancer •                        
Avec métastase(s) •                        
Sous traitement actuellement •                        
HIV •                        
Immunosupprimé •                        
Autres antécédents med. •                        
Médication prise à la maison                          
Inhibiteurs de l'enzyme de conversion •                        
Antagoniste des récepteurs de l'angiotensine
Stéroïdes systémiques •                        
Anticoagulants •                        
Colchicine •                        
Autre médication immunosuppressive •                        
Analyses de laboratoire                          
Décompte des globules blancs   • • • • • max            
Décompte des Neutrophiles   • • • • • max            
Décompte des Lymphocytes   • • • • • min            
Décompte des Monocytes   • • • • • max            
Décompte des Éosinophiles   • • • • • max            
Décompte des Basophiles   • • • • • max            
Décompte des plaquettes   • • • • • min            
Mesure de l'hémoglobine   • • • • • min            
Urée   • • • • • max            
Créatinine   • • • • • max            
NT-proBNP   • • • • • max            
BNP   • • • • • max            
Sodium Na+   • • • • • max            
Potassium K+   • • • • • max            
Protéine C-réactive (CRP)   • • • • • max            
LDH   • • • • • max            
CPK (CK)   • • • • • max            
Albumine   • • • • • min            
AST   • • • • • max            
ALT   • • • • • max            
Procalcitonine (PCT)   • • • • • max            
Troponine T hs   • • • • • max            
Troponine I hs   • • • • • max            
Troponine T   • • • • • max            
Troponine I   • • • • • max            
APTT   • • • • • max            
International Normalized Ratio (INR)   • • • • • max            
Triglycérides   • • • • • max            
Bilirubine totale   • • • • • max            
Bilirubine directe (conjuguée)   • • • • • max            
Glucose   • • • • • max            
Lactate Veineux   • • • • • max            
D-Dimère   • • • • • max            
Fibrinogène   • • • • • max            
Ferritine   • • • • • max            
IL-6   • • • • • max            
CD4   • • • • • min            
CD8   • • • • • min            
Support                          
Support respiratoire   • • • • • •            
Oxygénothérapie par canule / masque   • • • • • •            
Support non invasif par LNHD   • • • • • •            
Support non invasif CPAP/BPAP   • • • • • •            
Support invasif avec ventilation mécanique   • • • • • •            
Nombre de jours sous ventilation mécanique             •            
SpO2 (plus basse associée avec le support le plus élevé)   • • • • • •            
FiO2 (en lien avec SpO2)   • • • • • •            
Thérapie de support   • • • • • •            
Vasopresseurs / inotropes   • • • • • •            
Nombre de jours sous             •            
Positionnement ventral   • • • • • •            
iNO   • • • • • •            
ECMO   • • • • • •            
Support invasif HFOV (High-frequency oscillatory ventilation)   • • • • • •            
Trachéostomie   • • • • • •            
Transfusion de produits sanguins   • • • • • •            
Agents neuro-bloquants   • • • • • •            
Dialyse / hémofiltration   • • • • • •            
Autre, préciser   • • • • • •            
Score de fragilité                          
Score de fragilité   •*         • • • • • • •
Résumé hospitalier                          
Date et heure de l'arrivée à l'hôpital             •            
Visite à l'urgence seulement             •            
Est-ce un transfert d'un autre établissement ?             •            
Nom de l'établissement             •            
Si transféré d'un autre hôpital, date d'admission initiale             •            
Date d'admission aux soins intensifs             •            
Date de congé des soins intensifs             •            
Date de congé de l'hôpital             •            
Disposition             •            
Statut lors du congé             •            
Si COVID positif, quel est le degré de sévérité (selon WHO) le plus sévère atteint?             •            
Habilité à prendre soin de soi au moment du départ de l'hôpital vs pré-COVID             •            
Dernier niveau de soin             •            
Diagnostic COVID et test de pathogènes                          
Date du test diagnostic pour COVID19             •            
Résultat             •            
Type d'échantillon             •            
Autres infections virales documentées durant l'hospitalisation             •            
Adenovirus             •            
Influenza             •            
RSV             •            
Parainfluenza             •            
Rhinovirus / Enterovirus             •            
Metapneumovirus             •            
Autre, préciser             •            
Autres infections bactériennes documentées durant l'hospitalisation             •            
Complications durant l'hospitalisation                          
SDRA             •            
Spécifier la sévérité             •            
Pneumonie bactérienne             •            
Pneumonie virale             •            
Bronchiolite             •            
Pneumonie organisée cryptogénique (POC)             •            
Embolie pulmonaire             •            
Thrombose veineuse profonde (DVT)             •            
Pneumothorax             •            
Épanchement pleural             •            
Fonction ventriculaire gauche             •            
LVEF             •            
Insuffisance cardiaque décompensée             •            
Myocardite             •            
Endocardite             •            
Péricardite             •            
Fibrillation auriculaire(FA)/Flutter             •            
Fibrillation/Tachycardie ventriculaire             •            
Autre type d'arythmie cardiaque             •            
Spécifier             •            
Arrêt cardiaque             •            
Ischémie cardiaque STEMI             •            
Ischémie cardiaque NSTEMI             •            
Accident vasculaire cérébral             •            
Pancréatite             •            
Accident ischémique transitoire             •            
Convulsions             •            
Méningite / Encéphalite             •            
Rhabdomyolyse / myosite             •            
Trouble de la coagulation             •            
coagulation intravasculaire disséminée
Bactériémie             •            
Anémie             •            
Hémorragie gastro-intestinale             •            
Dysfonction hépatique             •            
Insuffisance rénale aigue             •            
Hyperglycémie             •            
Hypoglycémie             •            
Autre             •            
Spécifier             •            
Autres tests effectués durant l'hopitalisation                          
Radiographie des poumons             •            
Tomodensitométrie thorax             •            
Tomodensitométrie de l'abdomen             •            
Tomodensitométrie de la tête             •            
ECG             •            
Échographie au point d'intervention (POCUS)             •            
Échocardiogramme             •            
Échographie cardiaque
Angiographie coronarienne (Cathétérisme cardiaque)             •            
Intervention coronarienne percutané(stent)             •            
Autres tests d'imagerie             •            
Médication durant l'hospitalisation                        
Remdesivir             •            
Ribavirin             •            
Lopinavir/Ritonavir ("Kaletra")             •            
Interferon alpha             •            
Interferon beta             •            
Neuraminidase inh             •            
Autre antiviral             •            
Préciser             •            
Azithromycin ("Zithromax")             •            
Autre antiobiotique             •            
Antifongique             •            
Corticostéroide systémique             •            
Hydroxychloroquine ("Plaquenil")             •            
Chloroquine ("Aralen")             •            
Ivermectin ("Stromectol")             •            
Tocilizumab ("Actemra")             •            
Sarilumab ("Kevzara")             •            
Kineret ("Anakinra")             •            
Autre immunomodulateur             •            
Colchicine             •            
Plasma convalescent             •            
Cellules souches / cellules T éduquées             •            
IVIG             •            
Autre traitement pour COVID-19             •            
Suivi                          
Visite à l'hôpital suite au congé               • • • • • •
Date admission               • • • • • •
Établissement               • • • • • •
Cause               • • • • • •
Statut fonctionnel                          
Mobilité               • • • • • •
Soins personnels               • • • • • •
Activités habituelles               • • • • • •
Douleur et inconfort               • • • • • •
Anxiété et dépression               • • • • • •
Essoufflement               • • • • • •
État de santé               • • • • • •
Quelle difficulte éprouvez-vous ...                          
à soulever ou porter une charge de 10 lbs?               • • • • • •
à marcher à travers d'une piece?               • • • • • •
à transférer d'une chaise a un lit?               • • • • • •
à monter 1 étages à pied?               • • • • • •
Combien de fois êtes-vous tombé dans la dernière année?               • • • • • •